MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chromobacterium violaceum ATCC 12472 chromosome

Total Repeats: 131681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005085	A	6	6	18	23	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005085	CAA	2	6	64	69	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005085	CGC	2	6	97	102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_005085	GCCG	2	8	122	129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_005085	CG	5	10	155	164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_005085	CGCC	2	8	280	287	0 %	0 %	25 %	75 %	34495456
7	NC_005085	CCG	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	34495456
8	NC_005085	CGA	2	6	352	357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	34495456
9	NC_005085	TCA	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	34495456
10	NC_005085	TCA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	34495456
11	NC_005085	TGG	2	6	447	452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	34495456
12	NC_005085	GC	3	6	480	485	0 %	0 %	50 %	50 %	34495456
13	NC_005085	CG	3	6	490	495	0 %	0 %	50 %	50 %	34495456
14	NC_005085	CGC	2	6	499	504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	34495456
15	NC_005085	CAGC	2	8	520	527	25 %	0 %	25 %	50 %	34495456
16	NC_005085	CCAAGG	2	12	528	539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	34495456
17	NC_005085	GCC	3	9	551	559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	34495456
18	NC_005085	CGCC	2	8	579	586	0 %	0 %	25 %	75 %	34495456
19	NC_005085	GGC	2	6	592	597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	34495456
20	NC_005085	GGC	2	6	611	616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	34495456
21	NC_005085	GC	4	8	689	696	0 %	0 %	50 %	50 %	34495456
22	NC_005085	CGG	2	6	757	762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	34495456
23	NC_005085	AGA	2	6	816	821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34495456
24	NC_005085	CAT	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	34495456
25	NC_005085	GC	3	6	877	882	0 %	0 %	50 %	50 %	34495456
26	NC_005085	TGA	2	6	901	906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34495456
27	NC_005085	TAC	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	34495456
28	NC_005085	GAC	2	6	947	952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	34495456
29	NC_005085	GAA	2	6	986	991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34495456
30	NC_005085	TTC	2	6	992	997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34495456
31	NC_005085	GGC	2	6	1022	1027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	34495456
32	NC_005085	GCC	2	6	1129	1134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	34495456
33	NC_005085	TGA	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34495456
34	NC_005085	AGGCCG	2	12	1170	1181	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	34495456
35	NC_005085	TTC	2	6	1211	1216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34495456
36	NC_005085	GC	3	6	1257	1262	0 %	0 %	50 %	50 %	34495456
37	NC_005085	GTG	2	6	1271	1276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	34495456
38	NC_005085	CCAG	2	8	1293	1300	25 %	0 %	25 %	50 %	34495456
39	NC_005085	GAAG	2	8	1321	1328	50 %	0 %	50 %	0 %	34495456
40	NC_005085	GCC	2	6	1346	1351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	34495456
41	NC_005085	AGA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34495456
42	NC_005085	TAC	2	6	1400	1405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	34495456
43	NC_005085	AAG	2	6	1433	1438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34495456
44	NC_005085	CG	3	6	1453	1458	0 %	0 %	50 %	50 %	34495456
45	NC_005085	CGG	2	6	1531	1536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	34495456
46	NC_005085	ACCAC	2	10	1542	1551	40 %	0 %	0 %	60 %	34495456
47	NC_005085	TGC	2	6	1554	1559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	34495456
48	NC_005085	GC	3	6	1585	1590	0 %	0 %	50 %	50 %	34495456
49	NC_005085	GCT	2	6	1624	1629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	34495456
50	NC_005085	TGC	2	6	1635	1640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	34495456
51	NC_005085	CGT	2	6	1760	1765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	34495457
52	NC_005085	CAC	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	34495457
53	NC_005085	CAG	2	6	1861	1866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	34495457
54	NC_005085	CGA	2	6	1867	1872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	34495457
55	NC_005085	CAC	2	6	1897	1902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	34495457
56	NC_005085	AAG	2	6	1910	1915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34495457
57	NC_005085	GC	3	6	1930	1935	0 %	0 %	50 %	50 %	34495457
58	NC_005085	CGG	2	6	1975	1980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	34495457
59	NC_005085	CGG	2	6	2031	2036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	34495457
60	NC_005085	GCT	2	6	2047	2052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	34495457
61	NC_005085	TTA	2	6	2155	2160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34495457
62	NC_005085	TGG	2	6	2205	2210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	34495457
63	NC_005085	GCC	2	6	2252	2257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	34495457
64	NC_005085	CAT	2	6	2296	2301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	34495457
65	NC_005085	GCT	2	6	2314	2319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	34495457
66	NC_005085	CGA	3	9	2329	2337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	34495457
67	NC_005085	ATC	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	34495457
68	NC_005085	GGT	2	6	2404	2409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	34495457
69	NC_005085	GC	3	6	2503	2508	0 %	0 %	50 %	50 %	34495457
70	NC_005085	GAA	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34495457
71	NC_005085	GAA	2	6	2609	2614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34495457
72	NC_005085	GGC	2	6	2633	2638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	34495457
73	NC_005085	CTG	2	6	2669	2674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	34495457
74	NC_005085	GCCG	2	8	2692	2699	0 %	0 %	50 %	50 %	34495457
75	NC_005085	GC	3	6	2736	2741	0 %	0 %	50 %	50 %	34495457
76	NC_005085	GCGG	2	8	2813	2820	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_005085	GCC	2	6	2825	2830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_005085	CTC	2	6	2850	2855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_005085	CGGG	2	8	2856	2863	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_005085	GCG	2	6	2897	2902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_005085	GCC	3	9	2905	2913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_005085	CAC	2	6	3042	3047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161594063
83	NC_005085	GGCC	2	8	3089	3096	0 %	0 %	50 %	50 %	161594063
84	NC_005085	GAA	2	6	3186	3191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161594063
85	NC_005085	GCG	2	6	3201	3206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161594063
86	NC_005085	CGG	2	6	3233	3238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161594063
87	NC_005085	CGG	2	6	3269	3274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161594063
88	NC_005085	GGT	2	6	3296	3301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161594063
89	NC_005085	GCTGAA	2	12	3320	3331	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	161594063
90	NC_005085	CCG	2	6	3368	3373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161594063
91	NC_005085	TCACCG	2	12	3394	3405	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161594063
92	NC_005085	CTT	2	6	3437	3442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161594063
93	NC_005085	TCCT	2	8	3513	3520	0 %	50 %	0 %	50 %	161594063
94	NC_005085	GAA	2	6	3567	3572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161594063
95	NC_005085	CGG	2	6	3587	3592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161594063
96	NC_005085	CAA	2	6	3623	3628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161594063
97	NC_005085	TGC	2	6	3634	3639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161594063
98	NC_005085	AG	3	6	3719	3724	50 %	0 %	50 %	0 %	161594063
99	NC_005085	CAA	2	6	3740	3745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161594063
100	NC_005085	CGG	2	6	3761	3766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161594063
101	NC_005085	TGA	2	6	3793	3798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161594063
102	NC_005085	AG	3	6	3824	3829	50 %	0 %	50 %	0 %	161594063
103	NC_005085	GCC	2	6	3834	3839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161594063
104	NC_005085	AAG	2	6	3840	3845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161594063
105	NC_005085	ACC	2	6	3858	3863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161594063
106	NC_005085	CGA	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161594063
107	NC_005085	CCAG	2	8	3928	3935	25 %	0 %	25 %	50 %	161594063
108	NC_005085	GGT	2	6	3971	3976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161594063
109	NC_005085	CTG	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161594063
110	NC_005085	ACG	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161594063
111	NC_005085	ATC	2	6	4038	4043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161594063
112	NC_005085	GCC	2	6	4062	4067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161594063
113	NC_005085	CG	3	6	4082	4087	0 %	0 %	50 %	50 %	161594063
114	NC_005085	CGC	2	6	4107	4112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161594063
115	NC_005085	GGCCTG	2	12	4128	4139	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	161594063
116	NC_005085	TGG	2	6	4195	4200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161594063
117	NC_005085	CCG	2	6	4210	4215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161594063
118	NC_005085	CAAG	2	8	4226	4233	50 %	0 %	25 %	25 %	161594063
119	NC_005085	TGC	2	6	4312	4317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161594063
120	NC_005085	ACC	2	6	4399	4404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161594063
121	NC_005085	CAT	4	12	4406	4417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161594063
122	NC_005085	CTG	2	6	4455	4460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161594063
123	NC_005085	CTT	2	6	4466	4471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161594063
124	NC_005085	TGG	2	6	4492	4497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161594063
125	NC_005085	GCC	2	6	4523	4528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161594063
126	NC_005085	GAC	2	6	4572	4577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161594063
127	NC_005085	CTG	2	6	4596	4601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161594063
128	NC_005085	CGCC	2	8	4679	4686	0 %	0 %	25 %	75 %	161594063
129	NC_005085	CTG	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161594063
130	NC_005085	CG	3	6	4701	4706	0 %	0 %	50 %	50 %	161594063
131	NC_005085	CAG	2	6	4788	4793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161594063
132	NC_005085	CCG	2	6	4834	4839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161594063
133	NC_005085	CTG	2	6	4857	4862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161594063
134	NC_005085	ACG	2	6	4876	4881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161594063
135	NC_005085	ATC	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161594063
136	NC_005085	GCG	2	6	4957	4962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161594063
137	NC_005085	CTG	2	6	4992	4997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161594063
138	NC_005085	GGC	2	6	4998	5003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161594063
139	NC_005085	CTG	2	6	5004	5009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161594063
140	NC_005085	GCT	2	6	5081	5086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161594063
141	NC_005085	ACC	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161594063
142	NC_005085	GCC	2	6	5185	5190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161594063
143	NC_005085	CGA	2	6	5225	5230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161594063
144	NC_005085	CAC	2	6	5237	5242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161594063
145	NC_005085	CGA	2	6	5252	5257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161594063
146	NC_005085	A	6	6	5388	5393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005085	CTG	2	6	5436	5441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_005085	GAC	2	6	5458	5463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_005085	C	6	6	5494	5499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
150	NC_005085	AG	3	6	5512	5517	50 %	0 %	50 %	0 %	34495459
151	NC_005085	ACC	2	6	5585	5590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	34495459
152	NC_005085	GTT	2	6	5612	5617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	34495459
153	NC_005085	GAC	2	6	5642	5647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	34495459
154	NC_005085	GTTC	2	8	5677	5684	0 %	50 %	25 %	25 %	34495459
155	NC_005085	CAT	2	6	5941	5946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	34495459
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158	NC_005085	CTTGCG	2	12	6071	6082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	34495459
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160	NC_005085	GAT	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	34495459
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162	NC_005085	CCG	2	6	6344	6349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	34495459
163	NC_005085	CAC	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	34495459
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167	NC_005085	GC	3	6	6433	6438	0 %	0 %	50 %	50 %	34495459
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172	NC_005085	TTC	2	6	6601	6606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_005085	TTC	2	6	6617	6622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_005085	G	6	6	6680	6685	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_005085	CTT	2	6	6760	6765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_005085	GAT	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_005085	TGC	2	6	6849	6854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_005085	C	6	6	6979	6984	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
182	NC_005085	CAACA	2	10	7021	7030	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
183	NC_005085	AGA	2	6	7034	7039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_005085	CAG	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_005085	TAC	2	6	7767	7772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	34495460
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198	NC_005085	TGG	2	6	8041	8046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	34495460
199	NC_005085	AAGAA	2	10	8071	8080	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
200	NC_005085	GGA	2	6	8083	8088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
201	NC_005085	CG	3	6	8150	8155	0 %	0 %	50 %	50 %	34495461
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259	NC_005085	TTC	2	6	10934	10939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34495462
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264	NC_005085	GCGG	2	8	11205	11212	0 %	0 %	75 %	25 %	34495462
265	NC_005085	GCTTG	2	10	11262	11271	0 %	40 %	40 %	20 %	34495462
266	NC_005085	TCAA	2	8	11322	11329	50 %	25 %	0 %	25 %	34495462
267	NC_005085	CTT	2	6	11347	11352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	34495462
268	NC_005085	TC	3	6	11498	11503	0 %	50 %	0 %	50 %	34495462
269	NC_005085	CAG	2	6	11672	11677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	34495462
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404	NC_005085	AAAT	2	8	17746	17753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_005085	ATAA	2	8	17767	17774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_005085	ACATC	2	10	17778	17787	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_005085	CGCCA	2	10	21727	21736	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

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